公积金逾期贷款会补扣，一般会在还贷日当日或者第二天开展补扣，当然也必须客户还贷账户里面有足够的资金。因为公积金贷款还款没有缓冲期，如果一客户出现连三累六这类比较严重的逾期行为的时候，公积金中心才能采取相应的行动。所以为了防止这些情况发生，客户还是得保持良好的借还纪录，尽量不要逾期。
把欠的房贷还清是公积金逾期挽救的唯一方式，可是借款能还上，征信可不一定能立刻修复。不良行为从停止之日起保存5年才能恢复征信，也表明公积金逾期还上后也还是要5年才能撤消逾期记录，让征信恢复的。
除非是银行原因导致没有及时扣费逾期的，例如银行在扣费日当日系统进行维护、升级没法扣费，等第二天系统维护后再扣费的，借款人可提出异议申请，让银行修改征信，如果符合征信修改规定，一般会在20个工作日内完成。